Rafael Elias é formado na base do Palmeiras, disputou seu primeiro jogo pelo time profissional em 2018 e em 2019 foi emprestado ao Atlético e Goiás. Em 2020, passou toda a temporada afastado por conta de uma punição por doping. Ele fez uso da hidroclorotiazida, uma substância diurética proibida pela Agência Mundial Antidoping (WADA).
De volta ao Palmeiras em 2021, o atacante ganhou oportunidades do técnico Abel Ferreira no Campeonato Paulista e também foi inscrito na primeira fase da Copa Libertadores. No entanto, não teve um bom desempenho. Em nove partidas, fez apenas um gol contra a Ferroviária.
Neste ano, diante do recomeço de sua carreira após o período afastado por doping, Rafael Elias pediu para não mais ser chamado pelo apelido de Papagaio, que o acompanhava desde as categorias de base, e sim pelo seu nome.
A saída do jovem atacante de 22 anos não é a única mudança pela qual passa o ataque do time alviverde, setor que deve ser o mais reformulado do elenco. O ídolo Dudu retornou de empréstimo, Deyverson também voltou, já foi inscrito, mas ainda não sabe se será utilizado por Abel Ferreira, e Borja, atualmente no Junior Barranquilla, também pode retornar em julho.
Em sua primeira participação na elite do futebol brasileiro, o Cuiabá soma o seu 17° reforço para a temporada. Além de Rafael Elias, já haviam sido apresentados o goleiro Walter, os laterais João Lucas e Uendel, os zagueiros Paulão, Walber, Marllon e Joaquim, os volantes Camilo, Pepê, Uillian Correia e Yuri, o meia Murilo Rangel e os atacantes Clayson, Jonathan Cafú, Guilherme Pato e Osman.