Em outubro, Agüero teve de ser substituído na partida contra o Alavés, pelo Campeonato Espanhol, depois de sinalizar dores na caixa torácica e no pescoço.
Em seguida, foi encaminhado para um hospital e teve diagnosticada uma arritmia cardíaca, transtorno no ritmo de batimento do coração.
O atacante passou por um episódio parecido quando tinha 12 anos. A expectativa era que ele se recuperasse e voltasse a atuar no campo, mas o problema deve colocar um ponto final em sua carreira, aos 33 anos.
Agüero foi contratado pelos catalães na última janela de transferências e assinou um contrato válido por duas temporadas, após fim do vínculo com o Manchester City.
Pelo Barcelona, jogou apenas cinco partidas e anotou um gol.